Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMM44O43615 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMM44O43615 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMM44O43615 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMM44O43615 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TIMM44O43615 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TIMM44O43615 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms