Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DYNC1LI2O43237 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI2O43237 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms