Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHUKO15111 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHUKO15111 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHUKO15111 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHUKO15111 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHUKO15111 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHUKO15111 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHUKO15111 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHUKO15111 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHUKO15111 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHUKO15111 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHUKO15111 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHUKO15111 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHUKO15111 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHUKO15111 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHUKO15111 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHUKO15111 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHUKO15111 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHUKO15111 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHUKO15111 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHUKO15111 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHUKO15111 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHUKO15111 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHUKO15111 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHUKO15111 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHUKO15111 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHUKO15111 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHUKO15111 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHUKO15111 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHUKO15111 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHUKO15111 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms