Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VPS37CA5D8V6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VPS37CA5D8V6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms