Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE3A1L190 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE3A1L190 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCE3A1L190 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms