Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ZIC4-217ENST00000525172 4152 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PNPLA6-220ENST00000600737 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 TTC8-205ENST00000358622 2297 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SFT2D1Q8WV19 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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