Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FP671120.4-201ENST00000629969 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 HAND2-204ENST00000621866 1337 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 PAX6-249ENST00000639034 1597 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NESP48681 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 SNAPC5-202ENST00000316634 1002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 MAPT-202ENST00000334239 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 AP000926.2-201ENST00000469983 358 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 RN7SL307P-201ENST00000490342 295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 AP001453.2-201ENST00000544553 391 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 MYL6B-207ENST00000550443 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 MYL6B-210ENST00000552568 703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 AC112236.2-201ENST00000608402 845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 MIR7847-201ENST00000610912 103 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 ANXA13-202ENST00000419625 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 LIPG-205ENST00000580036 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 ASS1-201ENST00000352480 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NESP48681 NTM-201ENST00000374784 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NESP48681 KCNK16-203ENST00000425054 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NESP48681 AC016924.1-201ENST00000511512 501 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NESP48681 AC092471.1-201ENST00000536497 572 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NESP48681 AC091544.2-201ENST00000555864 414 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NESP48681 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NESP48681 AL596094.1-201ENST00000608273 276 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NESP48681 FAM74A7-201ENST00000613652 727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NESP48681 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 UFSP2-201ENST00000264689 1630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 AOX3P-202ENST00000469595 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 ITPKB-IT1-201ENST00000412918 746 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 TIMM23B-202ENST00000451577 1152 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 ZNF226-212ENST00000588795 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NESP48681 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 LRRC6-201ENST00000250173 1672 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 C10orf128-203ENST00000374153 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 TMEM101-205ENST00000589334 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 TREM2-201ENST00000338469 860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 FAU-206ENST00000529259 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 IKBKE-202ENST00000579827 678 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 AC090844.3-201ENST00000583462 784 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 MAP3K14-AS1-207ENST00000588698 460 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 AC003005.2-201ENST00000595422 539 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 AC022150.2-201ENST00000596451 644 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 AC006547.1-207ENST00000601746 930 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 AC006547.1-210ENST00000609644 589 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NESP48681 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms