Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TTLL2-201ENST00000239587 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CBLB-203ENST00000403724 3350 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MED29-201ENST00000315588 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 IRF5-201ENST00000249375 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MAGED1-202ENST00000375695 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC019294.1-202ENST00000566174 2071 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CACNG4-201ENST00000262138 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 NDUFAF6-202ENST00000396113 2549 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 STAC2-201ENST00000333461 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SEPT10-203ENST00000397714 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL606970.1-201ENST00000445442 2559 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 WDR83OS-202ENST00000596731 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ETFBKMT-205ENST00000538463 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC245884.11-201ENST00000616950 1734 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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