Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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