Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 FAM157A-201ENST00000437428 1141 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TAF1P21675 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF1P21675 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms