Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 F2R-201ENST00000319211 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTMAP06454 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 PIGM-201ENST00000368090 4319 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTMAP06454 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTMAP06454 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTMAP06454 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTMAP06454 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTMAP06454 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTMAP06454 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTMAP06454 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTMAP06454 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms