Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AL353807.2-201ENST00000456382 220 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC008676.2-201ENST00000519499 741 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC073655.1-201ENST00000550111 493 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AL596094.1-201ENST00000608273 276 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 CD300A-201ENST00000310828 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 RNA5SP469-201ENST00000364165 109 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTPRMP28827 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTPRMP28827 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTPRMP28827 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTPRMP28827 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PTPRMP28827 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PTPRMP28827 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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PTPRMP28827 MTND6P14-201ENST00000433044 522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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PTPRMP28827 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 AP001107.8-201ENST00000530805 479 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PTPRMP28827 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ETV7-208ENST00000627426 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRMP28827 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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