Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGAP1Q96PV0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms