Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CRYAB-213ENST00000533475 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GAPVD1Q14C86 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GAPVD1Q14C86 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms