Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SMG5Q9UPR3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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