Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AGAP9Q5VTM2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AGAP9Q5VTM2 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms