Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARID4AP29374 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms