Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQG0

ERVK-11, Endogenous retrovirus group K member 11 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-11Q9UQG0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-11Q9UQG0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK-11Q9UQG0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms