Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNRC6BQ9UPQ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6BQ9UPQ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6BQ9UPQ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms