Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDC23Q9UJX2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC23Q9UJX2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms