Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DKK2Q9UBU2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms