Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ASF1BQ9NVP2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ASF1BQ9NVP2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms