Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LYRM2Q9NU23 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LYRM2Q9NU23 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms