Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SSU72Q9NP77 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSU72Q9NP77 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SSU72Q9NP77 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms