Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RAB18Q9NP72 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB18Q9NP72 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms