Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNW7

TXNRD2, Thioredoxin reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD2Q9NNW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TXNRD2Q9NNW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNRD2Q9NNW7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms