Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNRC6CQ9HCJ0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNRC6CQ9HCJ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms