Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIOBPQ9H2D6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIOBPQ9H2D6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIOBPQ9H2D6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms