Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIM15Q9C019 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIM15Q9C019 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms