Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
HIRIP3Q9BW71 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HIRIP3Q9BW71 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HIRIP3Q9BW71 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms