Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCF25Q9BQ70 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCF25Q9BQ70 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms