Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX50Q9BQ39 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX50Q9BQ39 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms