Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDF15Q99988 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDF15Q99988 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms