Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L3Q99457 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L3Q99457 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms