Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHOX2BQ99453 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms