Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CENPNQ96H22 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPNQ96H22 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPNQ96H22 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms