Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NXPE3Q969Y0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NXPE3Q969Y0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms