Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM63Q969Q1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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TRIM63Q969Q1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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TRIM63Q969Q1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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TRIM63Q969Q1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM63Q969Q1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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