Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBEC4Q8WW27 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOBEC4Q8WW27 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms