Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMC4Q7Z404 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms