Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE2R2Q712K3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UBE2R2Q712K3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms