Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC149Q6ZUS6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms