Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC141Q6ZP82 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC141Q6ZP82 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC141Q6ZP82 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms