Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40BQ6NWY9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40BQ6NWY9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms