Protein–RNA interactions for Protein: Q61711

Ibsp, Bone sialoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IbspQ61711 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IbspQ61711 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IbspQ61711 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IbspQ61711 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
IbspQ61711 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IbspQ61711 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IbspQ61711 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IbspQ61711 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IbspQ61711 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IbspQ61711 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IbspQ61711 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IbspQ61711 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IbspQ61711 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IbspQ61711 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IbspQ61711 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IbspQ61711 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IbspQ61711 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IbspQ61711 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IbspQ61711 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IbspQ61711 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IbspQ61711 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IbspQ61711 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IbspQ61711 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IbspQ61711 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IbspQ61711 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IbspQ61711 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IbspQ61711 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IbspQ61711 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms