Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
STRIP1Q5VSL9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STRIP1Q5VSL9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.9 ms