Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
RSPH4AQ5TD94 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RSPH4AQ5TD94 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RSPH4AQ5TD94 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms