Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC183Q5T5S1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC183Q5T5S1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms