Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KARSQ15046 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KARSQ15046 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KARSQ15046 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KARSQ15046 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KARSQ15046 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KARSQ15046 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KARSQ15046 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KARSQ15046 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KARSQ15046 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KARSQ15046 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KARSQ15046 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KARSQ15046 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KARSQ15046 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KARSQ15046 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KARSQ15046 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KARSQ15046 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KARSQ15046 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KARSQ15046 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KARSQ15046 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KARSQ15046 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KARSQ15046 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KARSQ15046 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KARSQ15046 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KARSQ15046 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KARSQ15046 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KARSQ15046 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KARSQ15046 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KARSQ15046 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KARSQ15046 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KARSQ15046 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KARSQ15046 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KARSQ15046 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KARSQ15046 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KARSQ15046 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KARSQ15046 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KARSQ15046 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KARSQ15046 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KARSQ15046 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KARSQ15046 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KARSQ15046 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KARSQ15046 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KARSQ15046 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KARSQ15046 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KARSQ15046 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KARSQ15046 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KARSQ15046 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KARSQ15046 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KARSQ15046 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KARSQ15046 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KARSQ15046 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KARSQ15046 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KARSQ15046 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KARSQ15046 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KARSQ15046 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KARSQ15046 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KARSQ15046 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KARSQ15046 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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