Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCN5AQ14524 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN5AQ14524 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN5AQ14524 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
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